Na terenie powiatu miechowskiego występuje wiele gatunków roślin objętych ścisłą ochroną gatunkową. Są to między innymi: dziewięćsił (bezłodygowy i popłocholistny), powojnik prosty, zawilec wielkokwiatowy, len włochaty, len złocisty, aster gawędka, miłek wiosenny, wiśnia karłowata, ostrożeń pannoński, kwiaty z rodziny storczykowatych.
W celu ochrony środowiska roślinnego i zwierzęcego, a także przyrody nieożywionej utworzono tu 9 rezerwatów przyrody.
Poniższa tabela przedstwia występowanie (na przestrzeni wielu lat) gatunków roślin objętych ochroną na terenie rezerwatów przyrody i obszarów Natura 2000. Obecnie część gatunków roślin mogła zaniknąć.
Objęte ochroną są także siedliska przyrodnicze do których zaliczamy między innymi murawy kserotermiczne, grąd i zarośla jałowca pospolitego.